Evl Olavi Seppälä paljasti Papinlahden Ilmatorjunta-museon kilven 29.7.1961, jolloin Ilmatorjuntamuseo katsottiin perustetuksi.

Vuonna 1967 Ilmatorjuntakoulu teki Puolustusministeriölle esityksen, jossa pyydettiin Hyrylän varuskunnan alueella oleva Kapteenin Puustelli tarvittavine maa-alueineen museokäyttöön. Puolustusministeriö suostui esitykseen edellyttäen, että museon perustaminen ei aiheuta valtiolle kustannuksia.

Ilmatorjuntamuseon rakentaminen alkoi lukuisten vapaaehtoista maanpuolustustyötä tekevien järjestöjen, yksityisten yritysten ja henkilöiden tukemana. Ilmatorjuntamuseo avattiin ensi kerran yleisölle 4.6.1969.

Vuonna 1987 Puolustusministeriö nimitti Ilmatorjuntamuseon sotahistorialliseksi erikoismuseoksi. Museon päärakennus oli jo osoittautunut liian pieneksi. Ilmatorjuntakalustoa jouduttiin pitämään ulkona sään armoilla. Erityisesti herkkä kuulosuunnin- ja valonheitinkalusto kärsi ulkosäilytyksestä. Museoikään tulleita elektronisia laitteita ei enää mahtunut sisätiloihin.

Ilmatorjuntamiesten talkooponnistelujen ja monien lahjoittajien tukemana valmistui museon ensimmäinen oikea näyttelyhalli vuonna 1996. Suunnitelmiin oli alun alkaen kuulunut kaksi hallia. Museonrakentajien voimat eivät kuitenkaan siihen heti riittäneet, vaan toisen hallin avajaisia jouduttiin odottamaan 4.6.2007 asti.

Viidenkymmenen vuoden työ Ilmatorjuntamuseon hyväksi on tuottanut lopulta arvokkaan kokonaisuuden ja monipuolisen kokoelman, josta voi ammentaa näyttelyihin ja yleisötyöhön.